145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4557 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  84.61 
 
 
1321 aa  906    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  86.03 
 
 
1297 aa  880    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  51.79 
 
 
1055 aa  677    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  86.56 
 
 
951 aa  1150    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  53.15 
 
 
1219 aa  675    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
934 aa  1552    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  83.58 
 
 
1170 aa  960    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  56.55 
 
 
815 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  49.39 
 
 
1168 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  55.6 
 
 
842 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  68.16 
 
 
462 aa  439  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  68.24 
 
 
459 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  48.45 
 
 
1147 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  49.82 
 
 
936 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.43 
 
 
1580 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  54 
 
 
835 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  44.6 
 
 
835 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  45.68 
 
 
1451 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  68.51 
 
 
426 aa  363  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.05 
 
 
835 aa  353  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.02 
 
 
838 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.03 
 
 
748 aa  338  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  59.6 
 
 
469 aa  335  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  64.72 
 
 
647 aa  324  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  66.46 
 
 
300 aa  313  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  77.37 
 
 
274 aa  308  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  77.19 
 
 
390 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  76.89 
 
 
315 aa  293  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  82.23 
 
 
360 aa  287  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  54.89 
 
 
835 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4764  hypothetical protein  84.86 
 
 
249 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0280415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4274  collagen-like protein  66.53 
 
 
327 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  46.49 
 
 
706 aa  247  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  48.84 
 
 
712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.02 
 
 
813 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  56.6 
 
 
512 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  51.86 
 
 
867 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  35.3 
 
 
1873 aa  216  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  46.99 
 
 
643 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  48.18 
 
 
585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  56.86 
 
 
347 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  56.86 
 
 
347 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.32 
 
 
2914 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  53.2 
 
 
258 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  55.05 
 
 
240 aa  159  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  43 
 
 
444 aa  153  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.27 
 
 
481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  46.49 
 
 
478 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  53.96 
 
 
639 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  43.04 
 
 
524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  68.71 
 
 
689 aa  142  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  35.55 
 
 
442 aa  138  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  48.46 
 
 
322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  51.77 
 
 
300 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2464  BclA protein  49.07 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.7 
 
 
542 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  53.15 
 
 
606 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  39.31 
 
 
403 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  50.22 
 
 
319 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  40.92 
 
 
645 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  54.6 
 
 
474 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2280  hypothetical protein  53.29 
 
 
184 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.210075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2449  hypothetical protein  53.29 
 
 
184 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  51.18 
 
 
473 aa  118  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.03 
 
 
400 aa  118  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.88 
 
 
298 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  41.8 
 
 
582 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.49 
 
 
492 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.58 
 
 
466 aa  114  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.88 
 
 
468 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  40.71 
 
 
587 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  36.59 
 
 
382 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2405  BclA protein  51.13 
 
 
199 aa  110  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  53.18 
 
 
348 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  50.52 
 
 
580 aa  100  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.17 
 
 
493 aa  97.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  45.07 
 
 
497 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.17 
 
 
582 aa  95.1  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  48.45 
 
 
523 aa  94.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2927  BclA protein  47.54 
 
 
119 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00860223 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.88 
 
 
2851 aa  92.8  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  49.7 
 
 
252 aa  92  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2255  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  91.3  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0181462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  43.84 
 
 
380 aa  88.6  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  64.71 
 
 
436 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  50.69 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  47.41 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.17 
 
 
439 aa  79.7  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.45 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  47.42 
 
 
1101 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  26.36 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  48.46 
 
 
299 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  46.04 
 
 
344 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  54.72 
 
 
438 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  46.54 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  42.75 
 
 
288 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  52.5 
 
 
212 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  54.35 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  54.35 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  45.93 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>