Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Tery_0397 |
Symbol | |
ID | 4241961 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Trichodesmium erythraeum IMS101 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_008312 |
Strand | - |
Start bp | 612482 |
End bp | 618103 |
Gene Length | 5622 bp |
Protein Length | 1873 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 57% |
IMG OID | 638105722 |
Product | phage tail Collar |
Protein accession | YP_720336 |
Protein GI | 113474275 |
COG category | |
COG ID | |
TIGRFAM ID | |
| 

|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 1 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 14 |
Fosmid unclonability p-value | 1 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | TTGAGAAAAG AAATGGAAGA TTTTTTAGAT CAAATTGTTT TTCCAGATAC TTCTTCTTTC CAAAGCACTC CTATTAACAC TCTTGTACCT GGAGAATCAA TAACTGTACC AGGTTTTGAG TTAGTTAATG GGCCCCCAAT TGCTGATCCC TCTCTATTTA TAGAAGTCCC AATTCCAATA ATACCAGGTT CACCTGGTCC TGTTGGTCCT GCAGGTCCAA GTGGTGCCCC TGGTCCTGTG GGTCCTATCG GTCCAAGTGG TGCCCCTGGT CCTGTGGGTC CTGTAGGTCC AATAGGTCCT GTGGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT GGTCTTGCTG GTCCTGTAGG TCCAGCTGGA GCTGATGGTG TTCCTGGTCT CACTGGTCCT ATTGGTCCTA TTGGTCCAAG TGGTGCCCCT GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCAACTGGA GCTCCTGGTC CCGCTGGTCC TGTAGGTCCA GCTGGAGCTG ATGGTGTTCC TGGTCTTGCT GGTCCAGCTG GTCCAATAGG TCCTGTAGGT CCGGCTGGAG CTGATGGTGT TCCTGGTCTT ACTGGTCCCA TTGGTCCTAT AGGTCCAAGT GGTGCCCCTG GTCCTGTAGG TCCAATAGGT CCTGTAGGTC CGGCTGGAGC TGATGGTGTT CCTGGTCTTG CTGGTCCTGT AGGTCCTGTA GGTCCTGTAG GTCCAACTGG AGCTCCTGGT CCCGCTGGTC CTGTAGGTCC TGTAGGTCCT GTAGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT GGTCTTGCTG GTCCTGTAGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CAACTGGAGC TCCTGGTCCC GCTGGTCTTG CTGGTCCAGC TGGTCCAATA GGTCCTGTAG GTCCGGCTGG 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Protein sequence | MRKEMEDFLD QIVFPDTSSF QSTPINTLVP GESITVPGFE LVNGPPIADP SLFIEVPIPI IPGSPGPVGP AGPSGAPGPV GPIGPSGAPG PVGPVGPIGP VGPAGADGVP GLAGPVGPAG ADGVPGLTGP IGPIGPSGAP GPVGPVGPTG APGPAGPVGP AGADGVPGLA GPAGPIGPVG PAGADGVPGL TGPIGPIGPS GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPVGPV GPVGPTGAPG PAGPVGPVGP VGPAGADGVP GLAGPVGPVG PVGPTGAPGP AGLAGPAGPI GPVGPAGADG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPA GPIGPVGPAG ADGVPGLAGP VGPVGPVGPV GPVGPVGPIG LTGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP AGPIGPVGPA GADGVPGLAG PVGPVGPVGP AGADGVPGLA GPVGPIGPVG PVGPTGAPGP AGPVGPIGPV GPAGADGVPG LAGPVGPVGP TGAPGPAGPV GPIGPVGPAG ADGVPGLAGP AGAPGPAGPV GPVGPTGAPG PAGPAGPIGP VGSAGADGVP GLTGPIGPIG PSGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLAGPAG ASGPAGPVGP IGPVGPAGAD GVPGLAGPVG PVGPTGAPGP VGPIGPVGPA GADGVPGLAG PAGAPGPAGP IGPVGPAGTD GVPGLAGPVG PVGPSGAPGP AGPIGPVGPT GAPGPAGPIG PVGPAGPAGG PAGPAGPIGP VGPAGPAGPI GPVGPAGSDG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPV GPIGPVGSAG ADGVPGLAGP AGAPGPAGPI GPVGPAGADG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPV GPVGPVGPTG APGPVGPVGP VGPIGLTGAP GPAGPIGPVG PAGADGVPGL AGPVGPVGPV GPTGAPGPAG PAGPIGPVGP AGADGVPGLT GPIGPIGPSG APGPVGPIGP VGPAGADGVP GLAGPVGPVG PVGPVGPTGA PGPAGPAGPI GPVGPAGADG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPA GPVGPIGPVG PAGADGVPGL AGPVGPVGPT GAPGPVGPVG PVGPIGLTGA PGPAGPIGPV GPAGADGVPG LAGPVGPVGP VGPTGAPGPA GPAGPIGPVG PAGADGVPGL TGPIGPIGPS GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPVGPV GPVGPVGPVG PTGAPGPAGP AGPIGPVGPA GADGVPGLTG PIGPIGPSGA PGPAGPVGPI GPVGPAGADG VPGLAGPVGP VGPTGAPGPV GPVGPVGPIG LTGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP AGPIGPVGPA GADGVPGLAG PVGPVGPAGA PGPAGPIGPV GPAGADGVPG LAGPAGAPGP AGPVGPIGPV GPAGADGVPG LAGPVGPIGP VGPVGPVGSA GADGVPGLAG PAGPVGPIGP VGPAGADGVP GLAGPAGPIG PVGPTGAPGP IGPIGPSGAP GPVGPIGPVG PAGADGIPGL AGPVGPVGPV GPTGAPGPIG PIGPSGAPGP VGPIGPVGPA GADGVPGLAG PAGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP VGPVGPVGPT GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPAGAP GPAGPIGPVG PAGAPGPAGP IGPVGPIGPS GAPGPVGPVG PAGADGAPGF TGPVGPVGPA GPIGATGPVG PAGADGAPGF TGPVGPVGPA GPIGATGPVG PTGPVGPAGP VGPTGPIGPG IPTLPIGYII AGDNSPTDFI TGEIVLWPGL SVPPGFFSLE GQVLPITGNN ELFNIVGNQY GGDGVNNFVL PNLVGISPVG RQLNQIEDSV TGQLFVEFPS GSGQFINADD FPGIAGGNTP LGQNLNNNIV VPA
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