134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0397 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  100 
 
 		 1873 aa  2728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  48.34 
 
 		 1580 aa  626  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  41.07 
 
 		 1219 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  44 
 
 		 1788 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.23 
 
 		 1055 aa  467  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  45.58 
 
 		 1168 aa  429  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  41.67 
 
 		 1297 aa  389  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  42.91 
 
 		 1170 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  40.49 
 
 		 1321 aa  358  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  42.26 
 
 		 815 aa  350  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  42.92 
 
 		 1147 aa  335  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  43.08 
 
 		 936 aa  320  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  47.17 
 
 		 842 aa  315  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  41.38 
 
 		 835 aa  311  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  40.45 
 
 		 835 aa  287  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  41.34 
 
 		 835 aa  288  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  41.06 
 
 		 748 aa  282  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  42.01 
 
 		 951 aa  261  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  39.55 
 
 		 838 aa  260  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  41.6 
 
 		 934 aa  257  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  41.46 
 
 		 835 aa  215  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  42.8 
 
 		 706 aa  213  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  41.15 
 
 		 1451 aa  211  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  51.57 
 
 		 712 aa  193  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.43 
 
 		 2914 aa  190  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.2 
 
 		 512 aa  187  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  47.4 
 
 		 459 aa  180  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  45.16 
 
 		 867 aa  178  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  41.22 
 
 		 462 aa  174  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1408 aa  163  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  45.53 
 
 		 813 aa  161  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  50.61 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52 
 
 		 585 aa  136  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  38.35 
 
 		 645 aa  134  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  51.07 
 
 		 606 aa  133  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  40.51 
 
 		 639 aa  131  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.77 
 
 		 444 aa  130  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  47.18 
 
 		 542 aa  129  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  46.04 
 
 		 322 aa  126  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.01 
 
 		 319 aa  127  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  49.48 
 
 		 403 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  36.31 
 
 		 524 aa  123  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  45.79 
 
 		 300 aa  122  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  36.32 
 
 		 442 aa  119  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  55.79 
 
 		 1101 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.79 
 
 		 582 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  42.34 
 
 		 400 aa  111  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  48.11 
 
 		 587 aa  108  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  40.23 
 
 		 466 aa  106  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  41.7 
 
 		 298 aa  105  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.76 
 
 		 2851 aa  104  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  39.54 
 
 		 426 aa  100  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  41.02 
 
 		 468 aa  98.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  51.92 
 
 		 348 aa  97.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  40.08 
 
 		 492 aa  95.9  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.12 
 
 		 473 aa  94  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.37 
 
 		 382 aa  91.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  41.82 
 
 		 478 aa  92  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  46.15 
 
 		 252 aa  90.5  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  46.46 
 
 		 481 aa  88.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  48.31 
 
 		 582 aa  87.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  39.72 
 
 		 469 aa  86.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.51 
 
 		 647 aa  85.9  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  54.11 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  44.74 
 
 		 347 aa  83.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  44.74 
 
 		 347 aa  83.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  49.14 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.55 
 
 		 493 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  31.57 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  43.89 
 
 		 439 aa  76.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.75 
 
 		 437 aa  74.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  41.63 
 
 		 326 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  50.65 
 
 		 344 aa  73.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  46.27 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  33.13 
 
 		 648 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.89 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.44 
 
 		 274 aa  70.1  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  53.39 
 
 		 212 aa  69.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  39.13 
 
 		 497 aa  68.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  28.81 
 
 		 366 aa  64.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.34 
 
 		 434 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  54.26 
 
 		 437 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  54.26 
 
 		 437 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  54.26 
 
 		 451 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.6 
 
 		 473 aa  64.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  51.4 
 
 		 258 aa  63.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  53.19 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  49.51 
 
 		 222 aa  59.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  40.37 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  48.35 
 
 		 445 aa  58.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  38.93 
 
 		 300 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  39.82 
 
 		 474 aa  57.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  48.25 
 
 		 1426 aa  56.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  41.3 
 
 		 288 aa  55.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  52.38 
 
 		 285 aa  55.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  54.4 
 
 		 219 aa  55.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  45.9 
 
 		 204 aa  55.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  54.65 
 
 		 253 aa  55.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  47.69 
 
 		 182 aa  53.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  52.29 
 
 		 436 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>