132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4235 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 
204 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  60.59 
 
 
203 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  34.5 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  36.74 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  35 
 
 
199 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  35 
 
 
199 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  35.89 
 
 
199 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  36.19 
 
 
195 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  36.41 
 
 
181 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  30.69 
 
 
174 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  32.71 
 
 
181 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  30.69 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  36.32 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  32.18 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  33.66 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  33.65 
 
 
178 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  33.17 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  33.94 
 
 
176 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  31.68 
 
 
165 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  31.37 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  29.41 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  31.22 
 
 
182 aa  88.2  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  33.33 
 
 
175 aa  88.2  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  32.85 
 
 
181 aa  88.2  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  31.68 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  30.54 
 
 
171 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  29.21 
 
 
172 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  30.56 
 
 
198 aa  85.1  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  33 
 
 
172 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  33.5 
 
 
175 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  32.35 
 
 
167 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  36.02 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  30.59 
 
 
196 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  29.7 
 
 
171 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  32.68 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  31.53 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  31.05 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  30.24 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  29.61 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  28.97 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  28.31 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  28.97 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  32.04 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  31.07 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  30.58 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  54.55 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  29 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  53.85 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  26.73 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  32.18 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  29.9 
 
 
169 aa  79  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  40.5 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  30.19 
 
 
181 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  30.62 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  43.48 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  30.35 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  30.54 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  29.56 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  50.77 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  29.7 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  28.22 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  54.55 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  31.31 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  46.03 
 
 
177 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  53.23 
 
 
80 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  41.77 
 
 
183 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  47.62 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  56.67 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  28.57 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  29.8 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  26.09 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  32.02 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  56.67 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  32.84 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  27.27 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  29.61 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  26.64 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  27.8 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  47.37 
 
 
80 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2493  Tail Collar domain protein  50.85 
 
 
81 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2491  Tail Collar domain protein  50 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  47.69 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  47.54 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0754  phage tail collar domain-containing protein  45.16 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  27.65 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2124  Tail Collar domain protein  51.79 
 
 
84 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  31.53 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  27.59 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2885  Tail Collar domain protein  44.62 
 
 
84 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000255968  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2887  Tail Collar domain protein  53.7 
 
 
80 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00705187  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  39.47 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  45.31 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  28 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  32.69 
 
 
304 aa  64.7  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  32.02 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  27.31 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>