155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1027 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 403 aa  778    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  74.47 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  53.07 
 
 		 2914 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  49.13 
 
 		 842 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  43.89 
 
 		 643 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  42.99 
 
 		 712 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  50.46 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.39 
 
 		 813 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  41.78 
 
 		 585 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  56.63 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  53.2 
 
 		 1147 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46.11 
 
 		 2851 aa  146  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  53.43 
 
 		 748 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55.98 
 
 		 835 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  41.97 
 
 		 835 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  51.11 
 
 		 1168 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  41.1 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  45.5 
 
 		 459 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  37.06 
 
 		 706 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  41.1 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  46.64 
 
 		 478 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  41.07 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.63 
 
 		 689 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.06 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  53 
 
 		 936 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  50.71 
 
 		 1451 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.17 
 
 		 492 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  38.07 
 
 		 835 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  42.61 
 
 		 1297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  36.13 
 
 		 582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  45.12 
 
 		 481 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  49.33 
 
 		 838 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  46.35 
 
 		 815 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  48.69 
 
 		 1170 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.7 
 
 		 587 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  50.4 
 
 		 951 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.6 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  49.24 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  43.78 
 
 		 1219 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  45.05 
 
 		 1101 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  42.79 
 
 		 468 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  52.83 
 
 		 934 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  44.02 
 
 		 1055 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  53.99 
 
 		 1321 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  40.81 
 
 		 1873 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  55.33 
 
 		 867 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  43.66 
 
 		 1580 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  53.42 
 
 		 645 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  52 
 
 		 835 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  29.54 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  35.33 
 
 		 444 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  35.8 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  40.73 
 
 		 582 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  38.65 
 
 		 493 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  43.98 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.11 
 
 		 542 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  44.67 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  35.88 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  31.31 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  43.59 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  39.7 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  39.11 
 
 		 298 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  51.59 
 
 		 344 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  28.79 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  43.15 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  43.15 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  45.16 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  33.22 
 
 		 647 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  29.44 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  29.44 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  47.14 
 
 		 252 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  35.45 
 
 		 1788 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 274 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  38.07 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  54.87 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.35 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  35.59 
 
 		 469 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  46.63 
 
 		 767 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50.48 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50.48 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50.48 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.48 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  56.3 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1408 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.43 
 
 		 1426 aa  83.2  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  44.09 
 
 		 222 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  57.5 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  42.18 
 
 		 839 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  40.21 
 
 		 965 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  41.35 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.99 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  49.39 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  56.47 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  40.12 
 
 		 300 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  47.41 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  27.2 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  36.17 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  39.86 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  49.43 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  46.02 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>