152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2011 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
308 aa  584  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  57.79 
 
 
288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  51.23 
 
 
303 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  52.03 
 
 
297 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  49.66 
 
 
344 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  47.42 
 
 
283 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  45.23 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52.78 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  47.37 
 
 
2851 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  54.68 
 
 
382 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.56 
 
 
437 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  54.7 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  43.59 
 
 
400 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  53.21 
 
 
606 aa  93.2  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  55.12 
 
 
442 aa  92.4  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  49.23 
 
 
582 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.33 
 
 
2914 aa  92.4  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.6 
 
 
645 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  50.41 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  51.82 
 
 
347 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  51.82 
 
 
347 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.67 
 
 
473 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  48.25 
 
 
1219 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  50 
 
 
462 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  48.08 
 
 
1055 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  52.54 
 
 
813 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  42.64 
 
 
815 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  44.86 
 
 
469 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  38.95 
 
 
936 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  44.86 
 
 
647 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  40.36 
 
 
842 aa  85.9  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  51.43 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  41.61 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  55.1 
 
 
523 aa  85.1  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.72 
 
 
689 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5433  triple helix repeat-containing collagen  43.69 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  41.73 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1592  Collagen triple helix repeat protein  45.16 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  49.63 
 
 
542 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  51.67 
 
 
643 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  54.95 
 
 
706 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  55.79 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52.63 
 
 
585 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  51.75 
 
 
748 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.94 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  42.21 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  32.9 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.12 
 
 
1101 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  49.51 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.94 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  48.74 
 
 
1147 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  48.2 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  48.2 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  48.85 
 
 
512 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  46.02 
 
 
459 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.46 
 
 
587 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  51.38 
 
 
712 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  46.22 
 
 
639 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  32.76 
 
 
492 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  30.89 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  37.87 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  49.21 
 
 
1168 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  33.46 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  45.54 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  49.21 
 
 
835 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  51.09 
 
 
258 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  50.53 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.94 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  47.89 
 
 
1297 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
767 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.14 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  40.4 
 
 
835 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 
838 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  34.62 
 
 
717 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.54 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  41.91 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  48.74 
 
 
951 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  45.13 
 
 
436 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.9 
 
 
867 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  46.4 
 
 
835 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  41.96 
 
 
1451 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  49.55 
 
 
835 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.13 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0538  triple helix repeat-containing collagen  35.67 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  48.74 
 
 
1321 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  48.74 
 
 
1170 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  38.79 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.54 
 
 
934 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  51.69 
 
 
1873 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  45.04 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  44.3 
 
 
1977 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  37.4 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  40 
 
 
1426 aa  66.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  47.12 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  38.02 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  44.35 
 
 
444 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  34.95 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  44.34 
 
 
445 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  39.82 
 
 
644 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>