146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0586 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
606 aa  1130    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  73.18 
 
 
936 aa  262  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0348  hypothetical protein  58.7 
 
 
325 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  63.24 
 
 
380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  61.08 
 
 
462 aa  234  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  67.78 
 
 
1219 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  58.4 
 
 
1055 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  68.56 
 
 
815 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  56.6 
 
 
459 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.77 
 
 
813 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  46.83 
 
 
706 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  60.15 
 
 
712 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  60 
 
 
1451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  70 
 
 
300 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  54.49 
 
 
639 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.03 
 
 
748 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  59.94 
 
 
1168 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  59.45 
 
 
524 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  62.36 
 
 
512 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  54.98 
 
 
643 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  59.27 
 
 
1147 aa  177  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  56.83 
 
 
842 aa  174  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.02 
 
 
2914 aa  173  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  55.76 
 
 
585 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  44.82 
 
 
542 aa  159  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  60.63 
 
 
426 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  52.11 
 
 
835 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  57 
 
 
1580 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.4 
 
 
835 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  56.34 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  70.65 
 
 
326 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0887  Collagen triple helix repeat protein  53.91 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  67.88 
 
 
348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50.76 
 
 
582 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.76 
 
 
838 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  68.94 
 
 
252 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  49 
 
 
1297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  57.5 
 
 
481 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  57.5 
 
 
478 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 
1170 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  47.96 
 
 
322 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.21 
 
 
835 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  47.2 
 
 
867 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  57.56 
 
 
647 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  43.32 
 
 
442 aa  123  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.06 
 
 
645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.02 
 
 
319 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.97 
 
 
1321 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  46.08 
 
 
951 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.9 
 
 
403 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  37.89 
 
 
1873 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0886  hypothetical protein  51.3 
 
 
116 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  72.57 
 
 
347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  72.57 
 
 
347 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  44.74 
 
 
466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  41.64 
 
 
934 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  44.6 
 
 
444 aa  114  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.61 
 
 
492 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  45.82 
 
 
835 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  38.11 
 
 
400 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  43.96 
 
 
587 aa  108  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  44.02 
 
 
468 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.95 
 
 
473 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.42 
 
 
523 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  57.54 
 
 
474 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  48.92 
 
 
344 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  37.38 
 
 
298 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  43.01 
 
 
382 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.29 
 
 
2851 aa  99.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  66.67 
 
 
274 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46.5 
 
 
473 aa  98.6  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  52.16 
 
 
1148 aa  97.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  40.26 
 
 
493 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.41 
 
 
582 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  49.55 
 
 
1101 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  53.44 
 
 
258 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  75.26 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  63.56 
 
 
436 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  60.63 
 
 
300 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  67.86 
 
 
299 aa  90.5  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.89 
 
 
439 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  49.25 
 
 
222 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  52.5 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  72.22 
 
 
283 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  63.64 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  70.65 
 
 
285 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 
717 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.6 
 
 
239 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  46.47 
 
 
767 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  72.46 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  44.54 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  55.77 
 
 
434 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  44.85 
 
 
648 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  50.89 
 
 
240 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  52.73 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  54.81 
 
 
451 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  38.28 
 
 
839 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  61.88 
 
 
366 aa  79  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  54.81 
 
 
437 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  54.81 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>