138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1304 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 319 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  86.34 
 
 		 322 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  41.88 
 
 		 842 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.76 
 
 		 813 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  48.48 
 
 		 936 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  43.28 
 
 		 815 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 		 748 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  50.21 
 
 		 512 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  48.74 
 
 		 835 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  50.44 
 
 		 835 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  40.85 
 
 		 1219 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  43.44 
 
 		 1055 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  45.1 
 
 		 442 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  38.11 
 
 		 706 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.67 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  49.11 
 
 		 1168 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  46.91 
 
 		 712 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  41.52 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  47.96 
 
 		 1147 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  57.95 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  52.74 
 
 		 2914 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  46.33 
 
 		 1451 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  47.79 
 
 		 643 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.98 
 
 		 1580 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.77 
 
 		 1170 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  48.86 
 
 		 951 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.45 
 
 		 838 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.08 
 
 		 585 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  37.54 
 
 		 835 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  46.83 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.83 
 
 		 835 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  41.31 
 
 		 582 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  48.86 
 
 		 1297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.82 
 
 		 867 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.4 
 
 		 1321 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  43.62 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  36.47 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.08 
 
 		 542 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  51.41 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.23 
 
 		 645 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  44.09 
 
 		 934 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  44.24 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  59.29 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  42.21 
 
 		 587 aa  109  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  36.96 
 
 		 524 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.28 
 
 		 473 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.13 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  37.93 
 
 		 481 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  37.4 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.41 
 
 		 468 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  41.28 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  38.82 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  39.1 
 
 		 1873 aa  99.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.2 
 
 		 689 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  32.12 
 
 		 426 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  41.57 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  34.08 
 
 		 639 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.62 
 
 		 582 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.98 
 
 		 493 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  43.65 
 
 		 2851 aa  90.5  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  42.01 
 
 		 523 aa  89.4  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  42.98 
 
 		 1101 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  37.64 
 
 		 647 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  48.95 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  44.34 
 
 		 839 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  40.36 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  40.78 
 
 		 648 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48.41 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  31.52 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  49.59 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  44.88 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  42.05 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  49.21 
 
 		 767 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  43.02 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  47.27 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  47.27 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  52.63 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  51.61 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  38.66 
 
 		 1197 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  48.39 
 
 		 438 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  50 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  38.95 
 
 		 717 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  46.36 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  35.62 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  47.66 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  47.66 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.02 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  50.96 
 
 		 1426 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  46.32 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  50.44 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  58.97 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  30.89 
 
 		 688 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  47.17 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  52.68 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  45.6 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  27.41 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  32.35 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  38.33 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  34.85 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>