151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1924 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 466 aa  923    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  88.65 
 
 		 468 aa  810    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  37.29 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  37.53 
 
 		 582 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  32.83 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  33.01 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.94 
 
 		 585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  43.63 
 
 		 936 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.23 
 
 		 748 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.57 
 
 		 842 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  48 
 
 		 1168 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  45.98 
 
 		 835 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  40.08 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  45.13 
 
 		 712 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  45.33 
 
 		 835 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  45.68 
 
 		 1451 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  44.84 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  51.1 
 
 		 582 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  47.14 
 
 		 706 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  45.65 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1147 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.5 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  45.87 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  45.08 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  45.91 
 
 		 2914 aa  116  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.29 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  47.22 
 
 		 1321 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  48.17 
 
 		 1170 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  44.05 
 
 		 1055 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  42.66 
 
 		 815 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  47.22 
 
 		 1297 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  41.43 
 
 		 1219 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  40.67 
 
 		 813 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  44.66 
 
 		 951 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.85 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.24 
 
 		 319 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  43.8 
 
 		 1580 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  41.71 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.2 
 
 		 606 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  42.45 
 
 		 867 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.41 
 
 		 835 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  45.12 
 
 		 322 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  42.37 
 
 		 934 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  44.55 
 
 		 838 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  51.22 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  37.89 
 
 		 2851 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  41.46 
 
 		 300 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.79 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  44.04 
 
 		 426 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.31 
 
 		 689 aa  97.8  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  49.02 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.95 
 
 		 645 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  49.66 
 
 		 307 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  39.89 
 
 		 524 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  41.95 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.15 
 
 		 523 aa  93.2  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.74 
 
 		 835 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  48.39 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  54.13 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  54.13 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  47.69 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.97 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  40.91 
 
 		 1101 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  36.98 
 
 		 542 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  44.58 
 
 		 298 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  51.4 
 
 		 274 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  33.45 
 
 		 639 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  52.99 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  52.99 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  47.4 
 
 		 1873 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  45.07 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  46.03 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1408 aa  81.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  40.96 
 
 		 767 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  45.67 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  41.84 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.06 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.48 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  53.06 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  38.15 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.89 
 
 		 1426 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  47.46 
 
 		 222 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  44.62 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.04 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  43.24 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  54.76 
 
 		 285 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  37.77 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  48.44 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  44.07 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  32.68 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  42.19 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  48.6 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  55.71 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  32.2 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  53.57 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  42.64 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  48.24 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  42.48 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  35.46 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>