134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3124 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
1580 aa  2535    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  54.5 
 
 
1219 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  51.1 
 
 
1168 aa  546  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  54.27 
 
 
1055 aa  535  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  37.18 
 
 
1873 aa  479  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  41.67 
 
 
1297 aa  463  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  50.92 
 
 
842 aa  452  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.55 
 
 
1451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  51.12 
 
 
1147 aa  446  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  41.1 
 
 
1321 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  45.06 
 
 
1170 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  48.67 
 
 
936 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  52 
 
 
815 aa  380  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  48.9 
 
 
748 aa  365  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  45.35 
 
 
835 aa  350  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  39.75 
 
 
1408 aa  347  1e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  46.1 
 
 
835 aa  336  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.34 
 
 
835 aa  332  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  26.97 
 
 
1788 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  76.29 
 
 
445 aa  313  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.45 
 
 
838 aa  313  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.1 
 
 
934 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  44.78 
 
 
951 aa  303  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  48.36 
 
 
706 aa  286  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  42.48 
 
 
835 aa  259  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  51.94 
 
 
459 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.27 
 
 
712 aa  249  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  50 
 
 
462 aa  243  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  46.4 
 
 
813 aa  231  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.57 
 
 
2914 aa  230  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  45.67 
 
 
512 aa  222  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.49 
 
 
867 aa  209  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  40.76 
 
 
643 aa  196  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  53.39 
 
 
585 aa  180  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  54.48 
 
 
639 aa  153  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  49.45 
 
 
524 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  51.84 
 
 
606 aa  140  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.57 
 
 
442 aa  134  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  44.8 
 
 
426 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  55 
 
 
647 aa  133  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  44.74 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  46.28 
 
 
542 aa  129  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.23 
 
 
319 aa  127  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.46 
 
 
645 aa  123  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  59.62 
 
 
300 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  47.24 
 
 
444 aa  118  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.43 
 
 
469 aa  117  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  42.31 
 
 
478 aa  116  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  62.43 
 
 
474 aa  115  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  40.26 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  45.56 
 
 
403 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  40.23 
 
 
400 aa  110  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.95 
 
 
468 aa  108  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.8 
 
 
466 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  68.1 
 
 
348 aa  107  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.73 
 
 
587 aa  106  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  39.36 
 
 
492 aa  104  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  63.45 
 
 
252 aa  100  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  48.99 
 
 
582 aa  99.8  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  66.93 
 
 
380 aa  98.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  42.01 
 
 
382 aa  97.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.48 
 
 
689 aa  94.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  36.4 
 
 
298 aa  91.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  59.49 
 
 
326 aa  90.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  70.18 
 
 
274 aa  90.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  44.93 
 
 
582 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.1 
 
 
473 aa  87  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.46 
 
 
1101 aa  87  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  64.8 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  64.8 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  33.11 
 
 
767 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.92 
 
 
2851 aa  84  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  37.67 
 
 
497 aa  81.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  52.9 
 
 
258 aa  80.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.71 
 
 
493 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  65.52 
 
 
300 aa  80.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  47.83 
 
 
523 aa  79.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  36.59 
 
 
390 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  50.97 
 
 
295 aa  75.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  45.71 
 
 
307 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  59.82 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  42.33 
 
 
344 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  44.35 
 
 
212 aa  70.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  48.09 
 
 
240 aa  69.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  49.61 
 
 
439 aa  68.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  61.74 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  39.05 
 
 
1348 aa  68.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.38 
 
 
648 aa  68.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  50.42 
 
 
437 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  71.79 
 
 
283 aa  67  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3260  triple helix repeat-containing collagen  55.8 
 
 
265 aa  63.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.524263  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  64.65 
 
 
285 aa  63.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  64.17 
 
 
366 aa  63.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1759  collagen triple helix repeat protein  62.92 
 
 
237 aa  62  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  0.788316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  47.93 
 
 
437 aa  60.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50 
 
 
437 aa  59.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  53.61 
 
 
369 aa  59.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  71.21 
 
 
437 aa  59.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  35.96 
 
 
316 aa  58.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 
315 aa  58.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>