158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3477 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  67.34 
 
 
1147 aa  1130    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  71.23 
 
 
1168 aa  954    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  71.87 
 
 
748 aa  837    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  75.86 
 
 
706 aa  670    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  70.82 
 
 
1451 aa  839    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  62.68 
 
 
842 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 
936 aa  1653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  73.36 
 
 
813 aa  632  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  53.08 
 
 
1055 aa  475  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  53.57 
 
 
1219 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  52.09 
 
 
815 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  73.55 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  73.55 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  53.29 
 
 
712 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  46.63 
 
 
1580 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.39 
 
 
1170 aa  373  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  57.06 
 
 
512 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.77 
 
 
643 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  49.28 
 
 
1297 aa  345  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.62 
 
 
934 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.4 
 
 
1321 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  42.89 
 
 
951 aa  337  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  45.65 
 
 
835 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  41.51 
 
 
835 aa  334  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  48.32 
 
 
835 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.79 
 
 
838 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.8 
 
 
585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3762  collagen triple helix repeat protein  81.4 
 
 
293 aa  305  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000348192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  40.68 
 
 
835 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  54.61 
 
 
462 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  50.42 
 
 
459 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51 
 
 
2914 aa  248  4.9999999999999997e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  69.23 
 
 
606 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.94 
 
 
474 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  36.57 
 
 
1873 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  51.76 
 
 
867 aa  207  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  55.61 
 
 
639 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  48.79 
 
 
524 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  50.32 
 
 
436 aa  180  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  49.37 
 
 
647 aa  165  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  65.24 
 
 
300 aa  163  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  45.93 
 
 
442 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  47.38 
 
 
426 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.02 
 
 
645 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.97 
 
 
542 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  50.65 
 
 
322 aa  145  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  44.51 
 
 
444 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.85 
 
 
582 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  48.48 
 
 
319 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.67 
 
 
469 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.63 
 
 
466 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  53.98 
 
 
403 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.03 
 
 
492 aa  126  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  45.63 
 
 
468 aa  125  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  52.9 
 
 
473 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  46.63 
 
 
382 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.29 
 
 
587 aa  122  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  43.02 
 
 
298 aa  122  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.85 
 
 
2851 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  66.67 
 
 
252 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  64.42 
 
 
348 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.1 
 
 
473 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  43.87 
 
 
347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  43.87 
 
 
347 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  61.5 
 
 
326 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  57.05 
 
 
380 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  50.24 
 
 
400 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.69 
 
 
523 aa  111  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  45.86 
 
 
493 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1366  hypothetical protein  42.95 
 
 
313 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1477  hypothetical protein  42.95 
 
 
301 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 
582 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.55 
 
 
689 aa  102  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  41.94 
 
 
344 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  49.8 
 
 
1148 aa  97.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  61.76 
 
 
274 aa  96.3  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  47.52 
 
 
497 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  40.94 
 
 
222 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.31 
 
 
1101 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  62.26 
 
 
258 aa  88.6  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  42.35 
 
 
390 aa  88.2  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  66.67 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  73.61 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  62.68 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  46.67 
 
 
307 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  42.96 
 
 
212 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  37.76 
 
 
767 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.87 
 
 
366 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  73.91 
 
 
295 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  49.17 
 
 
439 aa  80.1  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  54.9 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48.36 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  48.45 
 
 
717 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  64.89 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  33.87 
 
 
648 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  57.45 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  75.86 
 
 
314 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  38.41 
 
 
316 aa  74.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 
1161 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.91 
 
 
283 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>