66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1748 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  100 
 
 
1408 aa  2727    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  37.11 
 
 
1580 aa  326  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  35.85 
 
 
842 aa  287  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  32.48 
 
 
835 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  32.51 
 
 
1055 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  33.28 
 
 
1219 aa  197  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  31.36 
 
 
838 aa  195  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  38.14 
 
 
462 aa  185  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  35.13 
 
 
459 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  35.21 
 
 
2914 aa  175  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  30.6 
 
 
835 aa  172  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  33.84 
 
 
835 aa  163  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  32.88 
 
 
815 aa  155  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  29.21 
 
 
639 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  30.61 
 
 
767 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.2 
 
 
648 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  28.34 
 
 
2851 aa  111  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  28.3 
 
 
839 aa  109  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  30.06 
 
 
1873 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  29.3 
 
 
426 aa  104  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  37.86 
 
 
587 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.19 
 
 
442 aa  99  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  35.38 
 
 
492 aa  97.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2195  triple helix repeat-containing collagen  39.78 
 
 
615 aa  95.1  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4480  hypothetical protein  39.78 
 
 
615 aa  95.1  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  34.65 
 
 
326 aa  90.9  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  35.91 
 
 
493 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  35.07 
 
 
252 aa  85.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  42.45 
 
 
307 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0933  hypothetical protein  33.81 
 
 
586 aa  83.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  34.72 
 
 
468 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  35.83 
 
 
582 aa  82.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  36.89 
 
 
582 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  34.68 
 
 
466 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  34.29 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  37.61 
 
 
212 aa  72.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  33.92 
 
 
403 aa  71.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  37.11 
 
 
444 aa  70.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2736  hypothetical protein  51.28 
 
 
142 aa  69.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  35.85 
 
 
473 aa  66.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  35.48 
 
 
300 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  28.15 
 
 
469 aa  63.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.83 
 
 
950 aa  61.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  41.46 
 
 
299 aa  61.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  32.98 
 
 
523 aa  60.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.01 
 
 
2105 aa  60.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.56 
 
 
2954 aa  58.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  40.59 
 
 
183 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  36.84 
 
 
1426 aa  56.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 
390 aa  55.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  36.97 
 
 
219 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.48 
 
 
833 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  24.56 
 
 
347 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  33.66 
 
 
369 aa  51.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  24.56 
 
 
347 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.37 
 
 
1164 aa  51.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
1795 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.88 
 
 
1279 aa  49.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  32.55 
 
 
639 aa  49.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  35.11 
 
 
258 aa  48.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 
709 aa  48.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  26.17 
 
 
2911 aa  47.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  39.44 
 
 
190 aa  46.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  35.66 
 
 
434 aa  45.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  26.06 
 
 
745 aa  45.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  41.25 
 
 
1421 aa  45.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>