More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4582 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
639 aa  1273    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  45.42 
 
 
724 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  45.03 
 
 
680 aa  475  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 
572 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  35.44 
 
 
742 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.79 
 
 
717 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 
729 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  33.16 
 
 
739 aa  246  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  38.75 
 
 
620 aa  243  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  36.89 
 
 
728 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  34.7 
 
 
736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.41 
 
 
1424 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.03 
 
 
3427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  41.62 
 
 
813 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.59 
 
 
1963 aa  127  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  44.95 
 
 
2105 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.57 
 
 
2667 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.89 
 
 
1795 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.5 
 
 
2954 aa  124  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.74 
 
 
1279 aa  124  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.57 
 
 
980 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.12 
 
 
946 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  42.6 
 
 
595 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.87 
 
 
1236 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44 
 
 
1164 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.86 
 
 
850 aa  120  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.32 
 
 
1534 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.01 
 
 
1400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  48.31 
 
 
1895 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.58 
 
 
757 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 
982 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.15 
 
 
950 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.82 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.79 
 
 
615 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.61 
 
 
709 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 
1287 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.97 
 
 
526 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.78 
 
 
588 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
4334 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  37.04 
 
 
2145 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.77 
 
 
606 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 
686 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  36.33 
 
 
327 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  46.29 
 
 
243 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.78 
 
 
361 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.23 
 
 
460 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.1 
 
 
5171 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.3 
 
 
833 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  47.62 
 
 
686 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 
260 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.28 
 
 
9867 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 
795 aa  108  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  38.38 
 
 
491 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.94 
 
 
2668 aa  107  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 
589 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  44.75 
 
 
361 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  44.75 
 
 
361 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.89 
 
 
1363 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.11 
 
 
2885 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  45.93 
 
 
561 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 
3954 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 
385 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  40.69 
 
 
1544 aa  104  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.12 
 
 
387 aa  104  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  44.51 
 
 
585 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  44.27 
 
 
341 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  44.51 
 
 
582 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  44.69 
 
 
341 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  39.74 
 
 
965 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.35 
 
 
679 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 
232 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.95 
 
 
437 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.11 
 
 
1197 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  39.79 
 
 
387 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  49.59 
 
 
744 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.84 
 
 
1712 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  50 
 
 
219 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.43 
 
 
4687 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 
1532 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.92 
 
 
437 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  43.79 
 
 
824 aa  99.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35.25 
 
 
2911 aa  98.6  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.86 
 
 
2678 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.11 
 
 
1016 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.95 
 
 
421 aa  98.2  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  30.29 
 
 
613 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.05 
 
 
2775 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  35.07 
 
 
741 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  43.83 
 
 
3619 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  43.3 
 
 
4800 aa  97.4  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 
202 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44 
 
 
202 aa  97.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 
734 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.83 
 
 
3619 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  36.25 
 
 
2689 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  40.93 
 
 
1855 aa  95.9  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  37.44 
 
 
4798 aa  95.9  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  49.66 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.51 
 
 
1019 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  47.54 
 
 
219 aa  94.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>