131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2610 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 767 aa  1403    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  73.36 
 
 		 648 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  70.8 
 
 		 839 aa  985    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4075  hypothetical protein  86.61 
 
 		 137 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1408 aa  157  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  30.79 
 
 		 1219 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  31.61 
 
 		 1055 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  32.09 
 
 		 815 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0244  hypothetical protein  48.19 
 
 		 267 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  52.76 
 
 		 2914 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  51.22 
 
 		 382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  51.9 
 
 		 2851 aa  109  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  43.42 
 
 		 473 aa  105  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  47.93 
 
 		 582 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  48.88 
 
 		 442 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  50.57 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.68 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  51.16 
 
 		 403 aa  100  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  37.76 
 
 		 936 aa  100  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  44.38 
 
 		 813 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  31.56 
 
 		 459 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  31.48 
 
 		 1168 aa  97.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 462 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  44.97 
 
 		 585 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  52.91 
 
 		 319 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  46.38 
 
 		 322 aa  92.8  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  36.12 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  32.46 
 
 		 512 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.93 
 
 		 712 aa  90.9  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  35.12 
 
 		 481 aa  90.9  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  42.6 
 
 		 466 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.17 
 
 		 492 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  35.31 
 
 		 1147 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  44.38 
 
 		 468 aa  90.1  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.33 
 
 		 493 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  43.82 
 
 		 643 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  29.54 
 
 		 748 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 300 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  34.12 
 
 		 1580 aa  87.4  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  40.91 
 
 		 647 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  38.6 
 
 		 469 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  37.16 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  41.21 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  42.07 
 
 		 1451 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  34.74 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  33.74 
 
 		 835 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.61 
 
 		 842 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  43.09 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.34 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  42.78 
 
 		 838 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  32.91 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  34.55 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  42.35 
 
 		 587 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  47.47 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.72 
 
 		 689 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.37 
 
 		 835 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  44.64 
 
 		 951 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  32.22 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1773  hypothetical protein  45.63 
 
 		 355 aa  77  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.457956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  36.97 
 
 		 835 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  43.48 
 
 		 867 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  43.96 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  44.37 
 
 		 283 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.79 
 
 		 1101 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48.84 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  34.3 
 
 		 426 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  47.58 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  33.47 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  37.97 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  50.53 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  31.54 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  43.68 
 
 		 1297 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4112  hypothetical protein  57.81 
 
 		 314 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2235  hypothetical protein  52.24 
 
 		 347 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  40.5 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  44.76 
 
 		 303 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  32.43 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  48.03 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.46 
 
 		 1426 aa  68.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  31.4 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  38.04 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  31.51 
 
 		 833 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  42 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  54.62 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  39.57 
 
 		 348 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  53.26 
 
 		 438 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  37.45 
 
 		 645 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  39.51 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  41.27 
 
 		 2397 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  60.53 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50.52 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  51.65 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  51.65 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  42.63 
 
 		 1170 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  41.62 
 
 		 1321 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  45 
 
 		 1873 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  26.45 
 
 		 316 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.92 
 
 		 934 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  41.92 
 
 		 183 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>