57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1525 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  888    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  30.3 
 
 		 275 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  31.78 
 
 		 254 aa  87  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.46 
 
 		 1882 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  35.37 
 
 		 1842 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  30.13 
 
 		 271 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  29.44 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2594  hypothetical protein  31.73 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  36.43 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  33.57 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  38.14 
 
 		 1052 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  31.01 
 
 		 1732 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1247 aa  63.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  31.17 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.77 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32.86 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  28.12 
 
 		 2392 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  37.89 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  29.14 
 
 		 1518 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  32.24 
 
 		 382 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 589 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  32.98 
 
 		 712 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  37.14 
 
 		 297 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  34.31 
 
 		 2495 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  27.37 
 
 		 730 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  27.1 
 
 		 691 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  38.17 
 
 		 352 aa  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  31.71 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  30 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  31.54 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  34.23 
 
 		 1426 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  36.3 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  27.7 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  35.86 
 
 		 2851 aa  47  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  31.14 
 
 		 492 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  28.7 
 
 		 286 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  30.29 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.7 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  30.61 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  35.16 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  31.82 
 
 		 643 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1408 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  30.38 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  30.38 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30 
 
 		 1055 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  31.54 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  29.27 
 
 		 403 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  32.07 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  34.15 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  34.68 
 
 		 203 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  34.58 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  30.9 
 
 		 2914 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  33.64 
 
 		 322 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>