33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0940 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  100 
 
 		 271 aa  557  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  83.39 
 
 		 270 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  62.17 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  43.32 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  38.77 
 
 		 254 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  33.8 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30.13 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  30.06 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.9 
 
 		 1882 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1052 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.68 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  28.24 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  29.38 
 
 		 1518 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  27.61 
 
 		 1732 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.95 
 
 		 1842 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.28 
 
 		 476 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  27.12 
 
 		 2031 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.22 
 
 		 352 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  26.21 
 
 		 657 aa  52.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  26.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  26.25 
 
 		 2392 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  24.53 
 
 		 456 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  23.12 
 
 		 730 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  27.39 
 
 		 158 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.93 
 
 		 203 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  27.27 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  36.51 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  25.93 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 399 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 589 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  23.17 
 
 		 320 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  24.29 
 
 		 506 aa  42.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>