53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0419 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  100 
 
 		 460 aa  939    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.59 
 
 		 1882 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  31.2 
 
 		 1518 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.19 
 
 		 1732 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1052 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.09 
 
 		 1842 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  33.94 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  31.7 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1247 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  36.64 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  32.79 
 
 		 352 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  29.01 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.2 
 
 		 476 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  26.35 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  34.69 
 
 		 2392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  31.53 
 
 		 361 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 589 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  25.9 
 
 		 2495 aa  99.4  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  35.15 
 
 		 320 aa  96.7  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  31.36 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  29.25 
 
 		 691 aa  87  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  36.42 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  30.88 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  34.44 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  31.09 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  32.91 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.48 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  25.94 
 
 		 848 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  31.68 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  34.21 
 
 		 254 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  33.57 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1118 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  33.55 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  33.74 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  31.06 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  27.54 
 
 		 158 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  28.67 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  30.89 
 
 		 987 aa  61.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  37.27 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  32.6 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  32.87 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  43.28 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  22.67 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  26.75 
 
 		 213 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  24.26 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  25.2 
 
 		 710 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  31.43 
 
 		 2031 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  32.93 
 
 		 286 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  23.14 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>