106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 2495 aa  5072    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  45.81 
 
 		 430 aa  196  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  48.26 
 
 		 478 aa  191  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  49.26 
 
 		 502 aa  185  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  32.82 
 
 		 456 aa  185  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  43.4 
 
 		 613 aa  182  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  26.54 
 
 		 1882 aa  180  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  42.93 
 
 		 550 aa  178  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  43.41 
 
 		 750 aa  176  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  48.35 
 
 		 651 aa  174  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  44.26 
 
 		 811 aa  173  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  43.89 
 
 		 330 aa  171  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  44.28 
 
 		 331 aa  167  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  37.11 
 
 		 454 aa  166  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  42.35 
 
 		 817 aa  164  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 342 aa  163  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  42.16 
 
 		 807 aa  159  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1055 aa  158  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  40.72 
 
 		 602 aa  158  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 589 aa  153  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  46.11 
 
 		 592 aa  151  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  23.62 
 
 		 1518 aa  146  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.04 
 
 		 434 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  41.94 
 
 		 316 aa  143  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  44.85 
 
 		 302 aa  142  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 399 aa  140  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.42 
 
 		 1842 aa  135  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 324 aa  135  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  33.71 
 
 		 352 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 753 aa  130  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.68 
 
 		 573 aa  129  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  45.45 
 
 		 440 aa  129  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  37.6 
 
 		 377 aa  128  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 532 aa  128  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  40.1 
 
 		 1732 aa  127  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  35.91 
 
 		 552 aa  122  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 757 aa  123  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  39.25 
 
 		 512 aa  122  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1247 aa  122  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.55 
 
 		 891 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 290 aa  117  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  38.25 
 
 		 293 aa  111  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  57.69 
 
 		 203 aa  106  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  35.88 
 
 		 237 aa  104  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  40.5 
 
 		 350 aa  103  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  34.12 
 
 		 395 aa  103  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  25.9 
 
 		 460 aa  99.4  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1052 aa  97.8  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  23.8 
 
 		 1732 aa  97.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  97.1  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.15 
 
 		 339 aa  95.9  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  35.16 
 
 		 578 aa  95.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  33.19 
 
 		 1557 aa  94  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  24.71 
 
 		 730 aa  91.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  36.03 
 
 		 1131 aa  89.4  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  36.03 
 
 		 1131 aa  89.4  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.68 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  24.11 
 
 		 538 aa  85.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  32.04 
 
 		 271 aa  85.5  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1336  cell wall binding repeat-containing protein  32.56 
 
 		 184 aa  81.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  28.66 
 
 		 2392 aa  81.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  33.52 
 
 		 1363 aa  80.9  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  42.06 
 
 		 269 aa  80.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  36.07 
 
 		 2821 aa  80.5  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  33.11 
 
 		 697 aa  79.7  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  31.61 
 
 		 465 aa  77.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1118 aa  77.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  34.29 
 
 		 269 aa  75.1  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  28.99 
 
 		 285 aa  73.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.27 
 
 		 476 aa  73.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  33.33 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  33.61 
 
 		 231 aa  68.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  30.45 
 
 		 254 aa  68.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.09 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  29.95 
 
 		 890 aa  65.5  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  31.67 
 
 		 691 aa  64.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.81 
 
 		 268 aa  64.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  29.55 
 
 		 1514 aa  64.3  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  26.29 
 
 		 458 aa  62.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  28.24 
 
 		 313 aa  62  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1009 aa  60.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1002 aa  60.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  25.44 
 
 		 1527 aa  60.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  24.9 
 
 		 589 aa  58.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  23.59 
 
 		 320 aa  57.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  36.51 
 
 		 1017 aa  57  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  27.62 
 
 		 1475 aa  57  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  55.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1025 aa  54.3  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.38 
 
 		 519 aa  53.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1764  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 1356 aa  53.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.420285  normal  0.647474 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  28.74 
 
 		 532 aa  52.8  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  26.84 
 
 		 380 aa  52.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  34.31 
 
 		 434 aa  50.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  24.32 
 
 		 587 aa  50.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  23.87 
 
 		 657 aa  48.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  29.31 
 
 		 420 aa  48.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.96 
 
 		 474 aa  48.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  30.41 
 
 		 270 aa  48.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>