53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0168 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  788    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  44.33 
 
 		 1052 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  42.03 
 
 		 1882 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.67 
 
 		 1842 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  44.56 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  39.85 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  38.67 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  29.79 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  32.49 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  31.31 
 
 		 1732 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  30.32 
 
 		 1518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  37.83 
 
 		 458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  32.59 
 
 		 2392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  28.27 
 
 		 730 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.46 
 
 		 361 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  35.38 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  33.8 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1247 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  34.12 
 
 		 2495 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  45.32 
 
 		 203 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  100  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  37.43 
 
 		 237 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  36.45 
 
 		 290 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  31.28 
 
 		 320 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  30.21 
 
 		 278 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  28.8 
 
 		 275 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.28 
 
 		 285 aa  86.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.27 
 
 		 657 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  24.62 
 
 		 691 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  36.09 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  31.29 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1055 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  33.1 
 
 		 286 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  28.88 
 
 		 225 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  27.95 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  24.27 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  27.92 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  40.28 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  31.19 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  32.58 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  27.11 
 
 		 848 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  34.78 
 
 		 506 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  28 
 
 		 2031 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  37.78 
 
 		 987 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  24.71 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1323 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  32.71 
 
 		 126 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>