43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0013 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  587  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  42.15 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  47.11 
 
 		 589 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  44.39 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  41.07 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  47.19 
 
 		 203 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  42 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  38.25 
 
 		 2495 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  40 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.84 
 
 		 1842 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  40.34 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  44.13 
 
 		 1882 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1055 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  29.28 
 
 		 2392 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.88 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  42 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.2 
 
 		 1052 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  34.33 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  35.76 
 
 		 1017 aa  75.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  31.98 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.81 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  31.3 
 
 		 1732 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.3 
 
 		 730 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  34.71 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  31.18 
 
 		 1518 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  37.89 
 
 		 109 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  30.66 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  35.29 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  27.64 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  25.89 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1118 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  29.13 
 
 		 657 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1247 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.1 
 
 		 361 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  35.48 
 
 		 506 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  36 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30.61 
 
 		 434 aa  45.8  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  33.66 
 
 		 691 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1331 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  28.87 
 
 		 565 aa  42.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>