44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1994 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  726    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.89 
 
 
1842 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.58 
 
 
1882 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.16 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  32.24 
 
 
1052 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.53 
 
 
460 aa  113  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  27.46 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  36.46 
 
 
1732 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.27 
 
 
2392 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  30.56 
 
 
1518 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  32.78 
 
 
1247 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  34.62 
 
 
320 aa  89.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  29.46 
 
 
476 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  27.6 
 
 
730 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  26.61 
 
 
458 aa  79.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  41.03 
 
 
111 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.35 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  30.34 
 
 
691 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  30.46 
 
 
225 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.09 
 
 
2495 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  25.74 
 
 
278 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  28.44 
 
 
271 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
589 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  26.77 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  27.33 
 
 
254 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  28.23 
 
 
1118 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  28.48 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  29.78 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  27.86 
 
 
1055 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  29.79 
 
 
456 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  26.54 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
399 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  29.23 
 
 
126 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  29.3 
 
 
2031 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  29.24 
 
 
203 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  24.48 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  38.6 
 
 
506 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  29.66 
 
 
231 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  27.64 
 
 
213 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  29.1 
 
 
293 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  25.95 
 
 
290 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  27.32 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  29.49 
 
 
1017 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>