50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1679 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
589 aa  1192    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  83.27 
 
 
269 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  45.52 
 
 
456 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  51.05 
 
 
352 aa  287  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  72.63 
 
 
203 aa  272  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  42.09 
 
 
399 aa  266  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  47.11 
 
 
293 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  45.21 
 
 
237 aa  160  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  45.59 
 
 
290 aa  156  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  31.36 
 
 
2495 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  33.47 
 
 
1882 aa  144  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  40.08 
 
 
395 aa  140  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.1 
 
 
1842 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  27.79 
 
 
1055 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  38.01 
 
 
1052 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  31.57 
 
 
458 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  28.05 
 
 
730 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  28.34 
 
 
538 aa  105  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  28.36 
 
 
460 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  25.62 
 
 
1732 aa  87  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.33 
 
 
2392 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.67 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  35.14 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  23.28 
 
 
1247 aa  75.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  25.86 
 
 
1518 aa  74.3  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  53.62 
 
 
109 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  35.06 
 
 
1017 aa  69.7  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  30.71 
 
 
269 aa  68.9  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.16 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  19.43 
 
 
1266 aa  64.7  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.81 
 
 
285 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  32.95 
 
 
361 aa  62  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  26.15 
 
 
1041 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  33.77 
 
 
313 aa  60.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  23.74 
 
 
1118 aa  60.1  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  47.37 
 
 
297 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  30 
 
 
657 aa  54.7  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  34.38 
 
 
434 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  28.81 
 
 
691 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2492  hypothetical protein  35.05 
 
 
660 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  37.74 
 
 
126 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  23.56 
 
 
380 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  25.58 
 
 
213 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  24.23 
 
 
275 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  24.3 
 
 
482 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
870 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  25.41 
 
 
270 aa  47.8  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  28.26 
 
 
734 aa  44.3  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>