55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2258 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  100 
 
 		 355 aa  711    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  37.93 
 
 		 1518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.84 
 
 		 1842 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  36.19 
 
 		 1052 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  38.67 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.67 
 
 		 1882 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  35.44 
 
 		 1732 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  36.64 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  42.7 
 
 		 2392 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  39.83 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  35.16 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  35.89 
 
 		 1247 aa  115  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  39.15 
 
 		 476 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  29.11 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  28.17 
 
 		 730 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  39.26 
 
 		 2495 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  32 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  32.13 
 
 		 456 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  34.12 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  33.18 
 
 		 848 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  29.38 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  35.98 
 
 		 290 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1118 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  33.81 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  36.49 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  30.06 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  34.51 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  32.94 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  34.5 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  27.39 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  29.78 
 
 		 203 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1055 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  35.16 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  32.86 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  33.09 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  33.57 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  29.03 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  41.18 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  31.82 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  30.57 
 
 		 987 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  32.31 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  28.16 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  28.74 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  33.33 
 
 		 269 aa  49.7  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.89 
 
 		 710 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  35.58 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.11 
 
 		 648 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  28.65 
 
 		 1015 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  33.8 
 
 		 286 aa  46.6  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  32.91 
 
 		 213 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>