68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1865 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  44.76 
 
 		 104 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.18 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  33.1 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  34.55 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  35.25 
 
 		 125 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4631  protein of unknown function DUF805  36.63 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.276161  normal  0.187204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  33.66 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  33.98 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  36.04 
 
 		 118 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1052 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  24.44 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  30.19 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  37.25 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  29.37 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  38.6 
 
 		 1732 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.94 
 
 		 1882 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  33.66 
 
 		 146 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  28.28 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  28.7 
 
 		 434 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  30.56 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  27.97 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.8 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.1 
 
 		 1842 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.45 
 
 		 1518 aa  45.8  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  28.83 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  27.27 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  31.43 
 
 		 112 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  28.16 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  28.89 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  31.58 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  28.16 
 
 		 117 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1247 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.93 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  30.19 
 
 		 355 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  34.19 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 114 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  35.14 
 
 		 122 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  35.14 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  35.14 
 
 		 118 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  28.93 
 
 		 143 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  29.2 
 
 		 128 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  29.2 
 
 		 128 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  29.2 
 
 		 128 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  30.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  29.2 
 
 		 121 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>