75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2197 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  100 
 
 
346 aa  702    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  44.55 
 
 
125 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  46.74 
 
 
123 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  42.2 
 
 
146 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  42.57 
 
 
116 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  39.62 
 
 
146 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  40.86 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  41 
 
 
117 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  41 
 
 
117 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  39.05 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  34.78 
 
 
123 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  35.58 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  35.58 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  35.58 
 
 
121 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  35.58 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  33.65 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  41.84 
 
 
114 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  38.26 
 
 
118 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  36.11 
 
 
114 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  42.31 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  37.39 
 
 
118 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  37.39 
 
 
122 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  62.8  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
155 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  36.08 
 
 
115 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  38 
 
 
118 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  37.62 
 
 
125 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  33.01 
 
 
121 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  35.24 
 
 
131 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  33.7 
 
 
109 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  35.92 
 
 
121 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  35.92 
 
 
121 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  35.92 
 
 
121 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  35.92 
 
 
121 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  38.54 
 
 
112 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  33.63 
 
 
123 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  27.97 
 
 
136 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  34.95 
 
 
121 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  33.62 
 
 
120 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  35.24 
 
 
126 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  40.85 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  32.38 
 
 
126 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  32.38 
 
 
126 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  38.37 
 
 
126 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  29.37 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  31.71 
 
 
193 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  31.37 
 
 
109 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  31.43 
 
 
214 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  32.73 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  29.71 
 
 
156 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  37.35 
 
 
109 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  31.58 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  35.35 
 
 
134 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  32.35 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  32.84 
 
 
117 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  31.58 
 
 
106 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  32.99 
 
 
179 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  36.51 
 
 
119 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>