113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1104 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  100 
 
 		 109 aa  224  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  51.85 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  54.13 
 
 		 109 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  47.71 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  38.68 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  47.66 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  39.02 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  47.17 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  47.17 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  46.08 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  47.62 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  45.79 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  41.07 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  40.19 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  38.33 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  41.96 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  34.43 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  39.45 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  40 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  46.07 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  40.21 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  39.25 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  37.61 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  35.04 
 
 		 215 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  38.68 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  38.68 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  38.68 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  38.68 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  34.23 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  38.33 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  32.85 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  41.58 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  36.79 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  39.62 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  36.79 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  39.6 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  38.79 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  34.91 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  35.04 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  35.04 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  35.04 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  35.85 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  42.5 
 
 		 393 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  34.29 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  37.37 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.48 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  32.26 
 
 		 200 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  30.95 
 
 		 168 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  39.44 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  36.05 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  28.97 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  31.73 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  31.75 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  33.7 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  34.69 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  33.01 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  33.01 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  32.04 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  33.64 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  35.42 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  36.9 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4184  protein of unknown function DUF805  30.48 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.150084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  32.69 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  49.02 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  31.91 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  31.91 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  31.54 
 
 		 371 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  30.19 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  30.65 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  32.32 
 
 		 360 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  25.2 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  27.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15681  hypothetical protein  27.62 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.119235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  28.23 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  43.14 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21090  predicted membrane protein  29.86 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  26.32 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  34.58 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  27.27 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0196  hypothetical protein  26.09 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.667333  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  27.03 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>