120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1014 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  66.07 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  56.88 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  52.07 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  59.05 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  45.59 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  53.21 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  52.31 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  46.55 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  44.92 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  44.92 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  44.92 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  44.92 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  44.17 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  46.15 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  43.7 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  51.3 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  45.69 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  42.31 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  45.3 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  44.44 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  45.3 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  44.54 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  44.54 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  44.54 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  44.54 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  40.34 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  42.5 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  42.74 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  42.86 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  45.9 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  43.8 
 
 		 116 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  43.48 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  44.55 
 
 		 346 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  46.15 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  37.76 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  38.79 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  42.37 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  39.06 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  36.13 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  44.35 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  38.74 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  46.84 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  40 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  42.48 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  41.49 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  36.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  37.25 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  45.98 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  40.96 
 
 		 393 aa  70.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  37.4 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  42.5 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  38.53 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  27.46 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  36.92 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  35.25 
 
 		 286 aa  67  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  42.17 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  35.14 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  26.83 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  34.86 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  36.22 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  32.5 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  32.99 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  32.99 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.66 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1123 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  30.47 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  26.35 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1868  protein of unknown function DUF805  35.24 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2214  hypothetical protein  35.24 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  31.5 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  30.25 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  27.08 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0829  hypothetical protein  31.91 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  30.71 
 
 		 371 aa  47  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  25.53 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  30.39 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4631  protein of unknown function DUF805  32.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.276161  normal  0.187204 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  30.77 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>