141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2991 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  73.45 
 
 		 115 aa  180  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  60.34 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  67.54 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  66.37 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  55.37 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  69.37 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  50.42 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  47.93 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  47.93 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  50.45 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  45.53 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  43.22 
 
 		 123 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  45.61 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  43.33 
 
 		 155 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  46.49 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  46.49 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  46.49 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  42.37 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  42.37 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  42.37 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  42.37 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  50 
 
 		 153 aa  98.6  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  42.37 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.66 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  43.8 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  45.08 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  44.35 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  41.96 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  43.22 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  36.57 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  41.07 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  45.83 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  47.93 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  46.08 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  37.8 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  38.4 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.21 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  44.95 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  39.05 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  40.82 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  42.37 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  41.32 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  40.38 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  37.72 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  35.78 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  39.05 
 
 		 346 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  40.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  40.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  40.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  40.5 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  42.05 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  36.07 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  39.67 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  36.56 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  31.97 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  33.01 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  37.82 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  42.11 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  34.19 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  43.75 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  33.61 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  35.16 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  30.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  28.83 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  39.47 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  26.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  26.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  34.17 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1123 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  33.05 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0250  hypothetical protein  30.51 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  34.67 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  35.62 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  32.14 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  35.62 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>