75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3937 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  61.25 
 
 		 360 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  58.81 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  41.61 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  37.79 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  40.14 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  41.04 
 
 		 186 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  35.51 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  32.64 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  45.59 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 		 123 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  46.38 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  46.38 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  41.1 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  43.94 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  44.12 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  43.94 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  33.91 
 
 		 146 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  34.29 
 
 		 125 aa  57  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  31.48 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  40.3 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  34.23 
 
 		 128 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  41.18 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  42.42 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  66.67 
 
 		 442 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  33.96 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.13 
 
 		 123 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  32.18 
 
 		 146 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  32.43 
 
 		 123 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  33.64 
 
 		 127 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  57.14 
 
 		 446 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  43.08 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  33.94 
 
 		 112 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1488  hypothetical protein  28.12 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885914  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  54.05 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  43.14 
 
 		 133 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  30.25 
 
 		 125 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  26.17 
 
 		 221 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  43.1 
 
 		 168 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  30.83 
 
 		 121 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  37.18 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  40.35 
 
 		 68 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  40.91 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  32.04 
 
 		 123 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  32.59 
 
 		 502 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  36 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  34.51 
 
 		 174 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  32.73 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0701  protein of unknown function DUF805  30.15 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  41.82 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  31.53 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  34.26 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  36.79 
 
 		 125 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  26.23 
 
 		 166 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  41.18 
 
 		 134 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  25.48 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  39.66 
 
 		 118 aa  42.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  23.87 
 
 		 678 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  37.5 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  37.5 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3247  hypothetical protein  25.34 
 
 		 175 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160157  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  41.38 
 
 		 116 aa  42.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1123 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  37.5 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>