120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3254 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  100 
 
 
118 aa  235  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  99.14 
 
 
118 aa  235  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  84.48 
 
 
118 aa  207  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  53.39 
 
 
128 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  53.39 
 
 
128 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  53.39 
 
 
128 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  53.39 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  47.9 
 
 
123 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3557  hypothetical protein  55.93 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  48.74 
 
 
123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  47.9 
 
 
121 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  45 
 
 
155 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  43.41 
 
 
156 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  48.74 
 
 
131 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  46.49 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  46.61 
 
 
123 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  49.56 
 
 
146 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  39.13 
 
 
117 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  39.13 
 
 
117 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  45.3 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  49.54 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  39.53 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3495  inner membrane protein YhaH  51.69 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3529  hypothetical protein  51.69 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.891346  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3425  inner membrane protein YhaH  51.69 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0469756  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3422  inner membrane protein YhaH  51.69 
 
 
121 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  44.25 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  45.61 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3592  inner membrane protein YhaH  50.85 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.532788  normal  0.457416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  43.86 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  47.37 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  38.35 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  46.9 
 
 
146 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  45.13 
 
 
123 aa  87  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  41.23 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  47.06 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  37.72 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  37.72 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1013  hypothetical protein  42.15 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  42.15 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2059  protein of unknown function DUF805  35.77 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0835  hypothetical protein  45.95 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  44.35 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1841  protein of unknown function DUF805  38.74 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  37.7 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  35.21 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1966  protein of unknown function DUF805  37.61 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  41.23 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  42.4 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0427  hypothetical protein  35.59 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.082341  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  27.44 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  37.63 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  48.53 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  41.67 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  32.56 
 
 
393 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  37.39 
 
 
346 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  32.5 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  38.79 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20900  predicted membrane protein  35.65 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.761588  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0450  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
210 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2568  hypothetical protein  38.04 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000926681  normal  0.0635574 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  30.16 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0656  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00883836  decreased coverage  0.00160249 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.39 
 
 
1123 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03531  hypothetical protein  35.29 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2367  hypothetical protein  26.44 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2412  hypothetical protein  26.44 
 
 
206 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  32.2 
 
 
386 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  33.01 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  30.43 
 
 
221 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4114  protein of unknown function DUF805  38.46 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  28.68 
 
 
215 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1521  hypothetical protein  31.17 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0995988  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1482  protein of unknown function DUF805  27.87 
 
 
371 aa  51.2  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.118245  normal  0.324958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3455  hypothetical protein  39.77 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  32.52 
 
 
214 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1470  hypothetical protein  32.63 
 
 
120 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00332173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1932  hypothetical protein  29.41 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0516254  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15831  hypothetical protein  30.53 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15461  hypothetical protein  30.53 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304816  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  31.58 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>