75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  87.22 
 
 		 355 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  61.25 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  40.39 
 
 		 316 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  39.67 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  43.28 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  38.51 
 
 		 186 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  36.94 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  38.14 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  34.95 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  42.68 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  41.43 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  26.22 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  34.9 
 
 		 502 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  33.65 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  46.15 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  44.62 
 
 		 183 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  39.68 
 
 		 119 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  43.1 
 
 		 68 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  41.35 
 
 		 146 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  30.56 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  37.68 
 
 		 172 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  30.19 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.19 
 
 		 123 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  30.19 
 
 		 117 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  43.4 
 
 		 270 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1488  hypothetical protein  28.82 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885914  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  35.09 
 
 		 126 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  27.62 
 
 		 123 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  28.85 
 
 		 118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  29.52 
 
 		 112 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  32.32 
 
 		 109 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  34.78 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  30.69 
 
 		 125 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  33.72 
 
 		 115 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  47.06 
 
 		 120 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  33.02 
 
 		 104 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  56.25 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  32.38 
 
 		 128 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  37.88 
 
 		 138 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  46.2  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  30.19 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  32.38 
 
 		 118 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  30.39 
 
 		 125 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  32.38 
 
 		 118 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  27.93 
 
 		 123 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  51.43 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  48.33 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2197  protein of unknown function DUF805  32.35 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  46.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.54 
 
 		 174 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  35.23 
 
 		 123 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  42 
 
 		 133 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1740  hypothetical protein  31.18 
 
 		 873 aa  43.1  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.550668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3234  protein of unknown function DUF805  36.99 
 
 		 143 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0175  hypothetical protein  34.41 
 
 		 214 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  25.86 
 
 		 114 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>