19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4344 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  84.95 
 
 
186 aa  290  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  69.89 
 
 
184 aa  224  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  59.14 
 
 
183 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  55.91 
 
 
183 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  38.38 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  34.87 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  30.41 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  42.71 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  48.53 
 
 
355 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  43.94 
 
 
318 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  35.35 
 
 
304 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  32.24 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  40.91 
 
 
310 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  41.54 
 
 
316 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  32.11 
 
 
352 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  37.31 
 
 
502 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3543  hypothetical protein  23.91 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3247  hypothetical protein  28.85 
 
 
175 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>