13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0237 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  719    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1936  hypothetical protein  39.09 
 
 		 231 aa  142  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2586  hypothetical protein  39.59 
 
 		 200 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0726753  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3424  hypothetical protein  43.36 
 
 		 205 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  36.81 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  34.72 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  35.11 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  37.33 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  36.76 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  33.78 
 
 		 172 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3088  hypothetical protein  25.37 
 
 		 160 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  34.21 
 
 		 186 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  28.36 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>