70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0800 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  89.26 
 
 
360 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  58.18 
 
 
318 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  39.54 
 
 
316 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  38.61 
 
 
310 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  41 
 
 
304 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  34.93 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  38.98 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  43.9 
 
 
184 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  48.48 
 
 
184 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  41.43 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  47.69 
 
 
183 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  33.65 
 
 
155 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  46.15 
 
 
183 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  32.5 
 
 
202 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  26.52 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  36.51 
 
 
126 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  40.58 
 
 
172 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  39.68 
 
 
119 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  43.1 
 
 
68 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  35.9 
 
 
156 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  32.38 
 
 
116 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  31.82 
 
 
134 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  36.05 
 
 
442 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  32.11 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  30.3 
 
 
115 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  40.38 
 
 
146 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  33.64 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  39.29 
 
 
126 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  47.17 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  48.98 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  28.85 
 
 
118 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  33.64 
 
 
127 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  29.25 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2546  hypothetical protein  32.08 
 
 
104 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  29.25 
 
 
117 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  31.37 
 
 
112 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  31.82 
 
 
118 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  33.85 
 
 
125 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.61 
 
 
120 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  31.82 
 
 
118 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  30.83 
 
 
123 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
109 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  51.43 
 
 
384 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  30.99 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  30.91 
 
 
113 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  42.59 
 
 
138 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  46.3 
 
 
128 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  46.67 
 
 
168 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  30.19 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  29.63 
 
 
123 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1488  hypothetical protein  45.28 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885914  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  38.75 
 
 
172 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  33.33 
 
 
123 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  42 
 
 
133 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  26.47 
 
 
114 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  31.48 
 
 
193 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.25 
 
 
1123 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>