17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3262 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  1020    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  36.24 
 
 
352 aa  86.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3247  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  37.84 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  36.73 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  40.54 
 
 
172 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  32.84 
 
 
318 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  30.93 
 
 
304 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1488  hypothetical protein  29.7 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885914  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  31.82 
 
 
183 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  34.44 
 
 
183 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  34.94 
 
 
186 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  31.18 
 
 
184 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  37.31 
 
 
184 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2349  hypothetical protein  30.63 
 
 
253 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0010372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  28.21 
 
 
349 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>