21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3155 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  329  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  32.18 
 
 
249 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  34.55 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  35.5 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  40.54 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  32.53 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  37.76 
 
 
355 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  30.66 
 
 
349 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  33.53 
 
 
184 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  39.13 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  36.23 
 
 
310 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  34.38 
 
 
360 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3247  hypothetical protein  29.7 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.160157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3868  hypothetical protein  33.8 
 
 
77 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3543  hypothetical protein  32.86 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  33.04 
 
 
304 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  31.91 
 
 
352 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  36.23 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  34.78 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  39.44 
 
 
364 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>