16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1418 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  360  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  71.81 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  61.41 
 
 		 183 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  67.93 
 
 		 184 aa  210  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  60.54 
 
 		 183 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  42.08 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  32.49 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  33.15 
 
 		 249 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  43.9 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  45.59 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  37.84 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  40 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  32.18 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  40.28 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  34.78 
 
 		 502 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>