16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3365 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  35.4 
 
 		 183 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  38.78 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  33.95 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  32.65 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  30.96 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  34.04 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  37.84 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  41.43 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  41.1 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  41.43 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  38.46 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  40.58 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  39.13 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  40.58 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  36.76 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>