55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5105 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  44.05 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  47.42 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  38.72 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  38.69 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  47.03 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  31.53 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  31.76 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  34.75 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  47.69 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  40.58 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  35.34 
 
 		 126 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  36.94 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  36.94 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  39.06 
 
 		 134 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  41.54 
 
 		 184 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  31.3 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  33.05 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  36.36 
 
 		 126 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  33.91 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  31.93 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  47.92 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  47.92 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  47.92 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  32.81 
 
 		 119 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  47.92 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  36.96 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  38.98 
 
 		 193 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  36.23 
 
 		 172 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  45.8  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  31.86 
 
 		 123 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  38.57 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  46.67 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  31.3 
 
 		 128 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0841771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  44.23 
 
 		 118 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 118 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.83 
 
 		 230 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  29.23 
 
 		 125 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>