19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4129 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  81.97 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  58.51 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  61.41 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  55.49 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  44.29 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  31.66 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  46.15 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  39.13 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  44.62 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  34.85 
 
 		 310 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3543  hypothetical protein  29.17 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  33.71 
 
 		 502 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  32.81 
 
 		 304 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3868  hypothetical protein  30.43 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0237  hypothetical protein  28.36 
 
 		 352 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556726  normal  0.298057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>