62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0602 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4571  hypothetical protein  64.08 
 
 		 304 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5105  hypothetical protein  48.84 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.697261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  41.97 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  42.81 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  36.6 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0415  hypothetical protein  30.98 
 
 		 186 aa  85.9  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  29.61 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0612  protein of unknown function DUF805  33.65 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.134263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3262  hypothetical protein  36.25 
 
 		 502 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0502  hypothetical protein  31.36 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4344  hypothetical protein  40.91 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  41.79 
 
 		 138 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1418  hypothetical protein  40.28 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50930  hypothetical protein  34.55 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  31.93 
 
 		 123 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3365  hypothetical protein  40.58 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0902126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3369  hypothetical protein  45.1 
 
 		 126 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000514405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3908  hypothetical protein  35.21 
 
 		 193 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3155  hypothetical protein  36.23 
 
 		 172 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3865  hypothetical protein  35.21 
 
 		 183 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  28.81 
 
 		 221 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  37.14 
 
 		 126 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  37.14 
 
 		 126 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3452  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1608  hypothetical protein  45.65 
 
 		 134 aa  49.3  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.860844  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  50 
 
 		 120 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4129  hypothetical protein  34.85 
 
 		 183 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  29.82 
 
 		 386 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  36.36 
 
 		 128 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4325  hypothetical protein  32.81 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2604  hypothetical protein  46 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462072 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  29.66 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  47.92 
 
 		 123 aa  47  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0068  hypothetical protein  35.59 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.410324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  30.19 
 
 		 125 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1902  protein of unknown function DUF805  38.46 
 
 		 166 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000685646 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1123 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  30.28 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  33.05 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  33.05 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  31.43 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3907  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1740  hypothetical protein  30.28 
 
 		 873 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.550668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  31.43 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  31.43 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  39.68 
 
 		 125 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.147236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  31.37 
 
 		 121 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2004  protein of unknown function DUF805  29.63 
 
 		 125 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3096  protein of unknown function DUF805  44.44 
 
 		 168 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0450  protein of unknown function DUF805  32.97 
 
 		 210 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.621893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  32.35 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19370  hypothetical protein  31.78 
 
 		 172 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>