41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1712 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  82.86 
 
 		 442 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 446 aa  893    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  52.05 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  35.91 
 
 		 363 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  32.1 
 
 		 387 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  31.55 
 
 		 384 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  31.18 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  31.01 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  32.05 
 
 		 354 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  33.14 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  31.84 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  32.25 
 
 		 350 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  34.66 
 
 		 735 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  34.66 
 
 		 735 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  34.8 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  30.21 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  35.13 
 
 		 337 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1006 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  29.63 
 
 		 312 aa  93.2  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  41.04 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 758 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  30.73 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  35.45 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  36.61 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0190  Zinc finger-domain-containing protein  29.21 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0243278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2279  MJ0042 family finger-like protein  29.37 
 
 		 294 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  31.48 
 
 		 325 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  33.64 
 
 		 697 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  41.86 
 
 		 1124 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  29.69 
 
 		 703 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  62.07 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  58.54 
 
 		 355 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  35.44 
 
 		 1144 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  42.55 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  34.18 
 
 		 1163 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1116  hypothetical protein  45.71 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2365  hypothetical protein  45.95 
 
 		 364 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  43.9  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3018  RDD domain-containing protein  28.7 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.792244  normal  0.129954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2976  RDD domain-containing protein  28.7 
 
 		 308 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0648796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>