25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3040 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  65.24 
 
 
337 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  34.83 
 
 
323 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  30.23 
 
 
363 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  31.07 
 
 
387 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  30.03 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  28.42 
 
 
395 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  29.36 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  28.81 
 
 
357 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  29.12 
 
 
384 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  29.34 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  43.85 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  37.65 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  45.39 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  33.84 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  37.18 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  35 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  31.72 
 
 
735 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  31.63 
 
 
735 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  42.65 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  34.69 
 
 
1006 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  27.73 
 
 
758 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  27.65 
 
 
363 aa  59.7  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  34.44 
 
 
703 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  42.34 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>