25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1298 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  100 
 
 
312 aa  615  1e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  28.18 
 
 
323 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  34.92 
 
 
363 aa  95.5  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  31.25 
 
 
389 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  30.85 
 
 
387 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  30.61 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  31.61 
 
 
384 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  43.85 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  41.83 
 
 
735 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  41.18 
 
 
735 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  32.92 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  35.4 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  35.4 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  42.57 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  31.68 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  38.85 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  29.63 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  33.75 
 
 
758 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  44.86 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  30 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  32.45 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  39.13 
 
 
1006 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  32.56 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  33.33 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  24.56 
 
 
703 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>