23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1650 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  100 
 
 
758 aa  1497    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  25.79 
 
 
735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  25.79 
 
 
735 aa  128  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  27.83 
 
 
323 aa  90.9  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  29.68 
 
 
336 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  29.51 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  33.75 
 
 
312 aa  69.3  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  28.36 
 
 
387 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  27.86 
 
 
442 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  28.92 
 
 
350 aa  58.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  27.21 
 
 
389 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  29.2 
 
 
354 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  28.78 
 
 
354 aa  57.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  26.92 
 
 
363 aa  57.4  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  26.37 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  28.78 
 
 
354 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  32.88 
 
 
337 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  26.81 
 
 
395 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  30.08 
 
 
342 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  30.4 
 
 
1006 aa  54.3  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  26.53 
 
 
357 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  25.66 
 
 
357 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1252  hypothetical protein  24.16 
 
 
353 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>