25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1592 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  98.02 
 
 
354 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  98.02 
 
 
354 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  71.67 
 
 
357 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  56.53 
 
 
395 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  57.95 
 
 
389 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  56.95 
 
 
387 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  58.38 
 
 
384 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  59.24 
 
 
363 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  36.97 
 
 
350 aa  166  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  30.25 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  33.83 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  33.84 
 
 
442 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  30.61 
 
 
735 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  30.27 
 
 
735 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  43.94 
 
 
1006 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  35 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  29.09 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  39.11 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  30.26 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  31.76 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  27.92 
 
 
758 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  36.03 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  30.88 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  28.03 
 
 
703 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>