26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2047 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  52.05 
 
 
446 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  51.42 
 
 
442 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  32.37 
 
 
363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  31.64 
 
 
387 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  30.64 
 
 
384 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  31.11 
 
 
389 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  30.64 
 
 
350 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  30.53 
 
 
336 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  37.65 
 
 
354 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  30.25 
 
 
354 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  31.09 
 
 
354 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  28.18 
 
 
312 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  33.84 
 
 
342 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  26.99 
 
 
357 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  31.03 
 
 
735 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  31.03 
 
 
735 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  31.64 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  27.83 
 
 
758 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  36.09 
 
 
1006 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  36.25 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  29.34 
 
 
363 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  38.67 
 
 
351 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  41.25 
 
 
697 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30.89 
 
 
703 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>