41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2511 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 
442 aa  882    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  82.86 
 
 
446 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  51.42 
 
 
323 aa  299  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  32.86 
 
 
387 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  31.28 
 
 
395 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  32.02 
 
 
389 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  34.91 
 
 
363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  30.99 
 
 
384 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  33.43 
 
 
350 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  34.15 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  32 
 
 
354 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  34.35 
 
 
354 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  29.65 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  34.66 
 
 
735 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  34.66 
 
 
735 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  36.79 
 
 
336 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  42.29 
 
 
342 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  37.35 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  36.14 
 
 
337 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  38.14 
 
 
1006 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  31.45 
 
 
363 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  28.7 
 
 
758 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  35.24 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  27.05 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2279  MJ0042 family finger-like protein  31.71 
 
 
294 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  35.78 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0190  Zinc finger-domain-containing protein  29.21 
 
 
288 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0243278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  42.22 
 
 
1124 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3937  hypothetical protein  68.97 
 
 
318 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  30.43 
 
 
325 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  41.33 
 
 
697 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  66.67 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  34.18 
 
 
1144 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2365  hypothetical protein  35.48 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  46.67 
 
 
360 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3174  hypothetical protein  30.25 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  32.91 
 
 
1163 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  24.06 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2245  putative protease  53.12 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  40.54 
 
 
1139 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  30 
 
 
703 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>