69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0018 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  100 
 
 
1006 aa  2005    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  40.83 
 
 
166 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1476  hypothetical protein  41.36 
 
 
166 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1533  hypothetical protein  40.74 
 
 
171 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1843  hypothetical protein  41.28 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3195  hypothetical protein  39.64 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461646  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1600  hypothetical protein  41.36 
 
 
171 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.209415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1594  hypothetical protein  40.51 
 
 
171 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  39.13 
 
 
166 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2446  hypothetical protein  33.72 
 
 
551 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.78808  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4248  hypothetical protein  37.29 
 
 
552 aa  113  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1621  hypothetical protein  36.76 
 
 
171 aa  112  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  41.1 
 
 
363 aa  111  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2993  hypothetical protein  37.71 
 
 
176 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1810  hypothetical protein  39.88 
 
 
171 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3071  hypothetical protein  37.71 
 
 
176 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1857  hypothetical protein  39.88 
 
 
171 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1818  hypothetical protein  39.88 
 
 
171 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2468  hypothetical protein  39.88 
 
 
171 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.186702  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1895  hypothetical protein  37.14 
 
 
176 aa  108  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  40.21 
 
 
446 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  37.74 
 
 
163 aa  104  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  37.58 
 
 
163 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2047  hypothetical protein  36.09 
 
 
323 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1855  hypothetical protein  37.89 
 
 
389 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.655192  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3038  hypothetical protein  37.66 
 
 
164 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2470  hypothetical protein  26.51 
 
 
395 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.932984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1816  hypothetical protein  26.67 
 
 
387 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1251  hypothetical protein  34.48 
 
 
160 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1253  hypothetical protein  39.53 
 
 
336 aa  95.5  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1808  hypothetical protein  26.98 
 
 
384 aa  94.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1651  hypothetical protein  34.05 
 
 
200 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  39.86 
 
 
354 aa  91.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  39.86 
 
 
354 aa  91.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  39.86 
 
 
354 aa  91.7  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1840  hypothetical protein  40.62 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1844  hypothetical protein  40.8 
 
 
350 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  33.33 
 
 
735 aa  82.4  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 
735 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  34.97 
 
 
312 aa  80.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3040  hypothetical protein  31.48 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  39.71 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  32.75 
 
 
161 aa  76.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  24.65 
 
 
357 aa  72  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4247  hypothetical protein  31.11 
 
 
325 aa  67  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.990494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2447  hypothetical protein  32.26 
 
 
351 aa  65.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1650  membrane protein-like protein  29.71 
 
 
758 aa  63.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  32.06 
 
 
189 aa  62.4  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  32.06 
 
 
189 aa  62.4  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  24.41 
 
 
357 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  23.5 
 
 
703 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3197  hypothetical protein  27.51 
 
 
337 aa  57.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.843374  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  23.36 
 
 
374 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  23.38 
 
 
374 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  23.24 
 
 
374 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  25.65 
 
 
189 aa  56.2  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  35.14 
 
 
697 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  25.79 
 
 
196 aa  51.2  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1474  hypothetical protein  38.71 
 
 
363 aa  51.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.03 
 
 
196 aa  48.5  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  23.19 
 
 
399 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  25.97 
 
 
384 aa  47  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  43.4 
 
 
183 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  21.95 
 
 
399 aa  45.8  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  24.38 
 
 
362 aa  45.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  23.48 
 
 
387 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  40.91 
 
 
199 aa  44.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  44.23 
 
 
190 aa  44.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>