17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1620 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  66.42 
 
 
399 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  65.66 
 
 
399 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  65.16 
 
 
399 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  65.16 
 
 
399 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  54.78 
 
 
374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  54.17 
 
 
374 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  54.72 
 
 
374 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1842  hypothetical protein  54.85 
 
 
242 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  31.34 
 
 
384 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  26.35 
 
 
357 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1475  hypothetical protein  26.65 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  24.79 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1841  hypothetical protein  69.49 
 
 
95 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  26.17 
 
 
362 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  23.75 
 
 
1006 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1252  hypothetical protein  33.75 
 
 
353 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>